論文/Publications
原著論文
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- Notaguchi M, Ichita M, Kawasoe T, Monda K, Kurotani K, Higaki T, Iba K and Hashimoto-Sugimoto M. (2024) PATROL1 functions in both shoot and root biomass increase. PLANTA. 260(5):105 DOI: 10.1007/s00425-024-04526-8
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- Kawakatsu Y, Okada R, Hara M, Tsutsui H, Yanagisawa N, Higashiyama T, Arima A, Baba Y, Kurotani K, Notaguchi M. (2024) Microfluidic device for simple diagnosis of plant growth condition by detecting miRNAs from filtered plant extracts. Plant Phenomics. 6 Article ID: 0162 DOI: 10.34133/plantphenomics.0162
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- Huang C, Kurotani K, Tabata R, Mitsuda N, Sugita R, Tanoi K, Notaguchi M. (2023) Nicotiana benthamiana XYLEM CYSTEINE PROTEASE genes facilitate tracheary element formation in interfamily grafting. Horticulture Research, uhad072, DOI:10.1093/hr/uhad072
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- Kurotani K, Hirakawa H, Shirasawa K, Tanizawa Y, Nakamura Y, Isobe S, Notaguchi M. (2023) Genome sequence and analysis of Nicotiana benthamiana, the model plant for interaction between organisms. Plant And Cell Physiology, 64: 248–257. DOI: 10.1093/pcp/pcac168
- Jantean L, Okada K, Kawakatsu Y, Kurotani K, Notaguchi M. (2022) Measurement of reactive oxygen species production by luminol-based assay in Nicotiana benthamiana, Arabidopsis thaliana and Brassica rapa ssp. rapa Plant Biotechnology DOI:10.5511/plantbiotechnology.22.0823a
- Kurotani K, Kawakatsu Y, Kikkawa M, Tabata R, Kurihara D, Honda H, Shimizu K, Notaguchi M. (2022) Analysis of plasmodesmata permeability using cultured tobacco BY‑2 cells entrapped in microfluidic chips J. Plant Res. DOI:10.1007/s10265-022-01406-8
- Shimizu K*, Kawakatsu Y*, Kurotani K*, Kikkawa M, Tabata R, Kurihara D, Honda H. and Notaguchi M. (2022) Development of Microfluidic Chip for Entrapping Tobacco BY-2 Cells PLoS ONE 17(4): e0266982. DOI:10.1371/journal.pone.0266982
- Kurotani K, Huang C, Okayasu K, Ichihashi Y, Shirasu K, Suzuki T, Higashiyama T, Niwa M. and Michitaka Notaguchi M. (2022) Discovery of the interfamily grafting capacity of Petunia, a floricultural species Horticulture Research 9: uhab056 DOI: 10.1093/hr/uhab056
- Kurotani K and Notaguchi M. (2021) Cell-to-cell connection in plant grafting – molecular insights into symplasmic reconstruction. Plant Cell Physiol. 62, 1362-1371 DOI: 10.1093/pcp/pcab109/6319604
- Okayasu K, Aoki K, Kurotani K, Notaguchi M.(2021) Tissue adhesion between distant plant species in parasitism and grafting. Commun & Integ Biol 14, 21-23 DOI:10.1080/19420889.2021.1877016
- Kawakatsu Y, Sawai Y, Kurotani K, Shiratake K, Notaguchi M. (2020) An in vitro grafting method to quantify mechanical forces of adhering tissues. Plant Biotechnology 20.0925a 10.5511/plantbiotechnology.20.0925a
- Honma Y, Adhikari PB, Kuwata K, Kagenishi T, Yokawa K, Notaguchi M, Kurotani K, Toda E, Bessho-Uehara K, Liu X, Zhu S, Wu X, Kasahara RD. (2020) High-quality sugar production by osgcs1 rice. Commun Biol 3, 617 DOI:10.1038/s42003-020-01329-x
- Notaguchi M, Kurotani K, Sato Y, Tabata R, Kawakatsu Y, Okayasu K, Sawai Y, Okada R, Asahina M, Ichihashi Y, Shirasu K, Suzuki T, Niwa M, Higashiyama T. (2020) Cell-cell adhesion in plant grafting is facilitated by β-1,4-glucanases. Science Vol. 369, Issue 6504: 698-702. DOI: 10.1126/science.abc3710
- Kurotani K*, Wakatake T*, Ichihashi Y, Okayasu K, Sawai Y, Ogawa S, Cui S, Suzuki T, Shirasu K, Notaguchi M. Host-parasite tissue adhesion by a secreted type of β-1,4-glucanase in the parasitic plant Phtheirospermum japonicum. Commun Biol 3, 407. DOI: 10.1038/s42003-020-01143-5
- Kurotani K, Tabata R, Kawakatsu Y, Sugita R, Okayasu K, Tanoi K, Notaguchi M. Autophagy is induced during plant grafting for wound healing. bioRxiv 2020.02.14.949453; DOI: 10.1101/2020.02.14.949453
- Endo M, Yoshida M, Sasaki Y, Negishi K, Horikawa K, Daimon Y, Kurotani K, Notaguchi M, Abe M, Araki T (2018) Re-evaluation of florigen transport kinetics with separation of functions by mutations that uncouple flowering initiation and long-distance transport. Plant & Cell Physiology 59: 1621-1629.
- Kurotani K, Yamanaka K, Toda Y, Ogawa D, Tanaka M, Kozawa H, Nakamura H, Hakata M, Ichikawa H, Hattori T, Takeda S (2015) Stress-tolerance profiling of a collection of extant salt-tolerant rice varieties and transgenic plants overexpressing abiotic stress tolerance genes Plant & Cell Physiology 56: 1867-1876.
- Kurotani K, Hattori T, Takeda S. (2015) Overexpression of a CYP94 family gene CYP94C2b increases internode length and plant height in rice. Plant Signal Behav 10 (7) e1046667
- Kurotani K, Hayashi K, Hatanaka S, Toda Y, Ogawa D, Ichikawa H, Ishimaru Y, Tashita R, Suzuki T, Ueda M, Hattori T, Takeda S. (2015) Elevated levels of CYP94 family gene expression alleviate the jasmonate response and enhance salt tolerance in rice. Plant & Cell Physiology 56: 779-789
- Hori Y, Kurotani K, Toda Y, Hattori T, Takeda S. (2014) Overexpression of the JAZ factors With mutated Jas domains causes pleiotropic defects in Rice spikelet development. Plant Signal Behav. 9 (10) e970414
- Toda Y, Tanaka M, Ogawa D, Kurata K, Kurotani K, Habu Y, Ando T, Sugimoto K, Mitsuda N, Katoh E, Abe K, Miyao A, Hirochika H, Hattori T, Takeda S. (2013) RICE SALT SENSITIVE3 forms a ternary complex with JAZ and class-C bHLH factors and regulates jasmonate-induced gene expression and root cell elongation. Plant Cell. 25:1709-25.
- Niwa M, Daimon Y, Kurotani K, Higo A, Pruneda-Paz JL, Breton G, Mitsuda N, Kay SA, Ohme-Takagi M, Endo M, Araki T (2013) BRANCHED1 interacts with FLOWERING LOCUS T to repress the floral transition of the axillary meristems in Arabidopsis. Plant Cell. 25:1228-42
- Ishikawa R, Aoki M, Kurotani K, Yokoi S, Shinomura T, Takano M, Shimamoto K (2011) Phytochrome B regulates Heading date 1 (Hd1)-mediated expression of rice florigen Hd3a and critical day length in rice. Mol Genet Genomics, 285: 461-470
- Takakura Y, Che FS, Ishida Y, Tsutsumi F, Kurotani K, Usami S, Isogai A, Imaseki H. (2008) Expression of a bacterial flagellin gene triggers plant immune responses and confers disease resistance in transgenic rice plants Mol Plant Pathol. 9: 525-9
- Abe M, Fujiwara M, Kurotani K, Yokoi S and Shimamoto K. (2008) Identification of dynamin as an interactor of rice GIGANTEA by tandem affinity purification (TAP).Plant & Cell Physiology 49, 420-432
- Tamada Y, Imanari E, Kurotani K, Nakai M, Andreo C, Katsura Izui K (2003) Effect of photooxidative destruction of chloroplasts on the expression of nuclear genes for C4 photosynthesis and for chloroplast biogenesis in maize. Journal of Plant Physiology, 160: 3-8
- Kurotani K, Hata S, and Izui K (1999) Light-Regulated Expression of the Gene for C4-form Phosphoenolpyruvate Carboxylase in Maize: Destabilization of mRNA by Okadaic Acid. Plant & Cell Physiology 40: 423-430
その他総説等
- 寄稿記事 黒谷賢一、荒井重勇、大井崇生、野田口理孝(2022) 「ペチュニアが異科接木できることを発見」 名古屋大学 電子光学研究のあゆみ pp.4-5
- 黒谷 賢一, 野田口 理孝 (2021) 「糖鎖の加水分解酵素が植物をつなぐ」 Glycoforum Vol.24 (1), A2 DOI: 10.32285/glycoforum.24A2J, 10.32285/glycoforum.24A2
- 黒谷 賢一, 野田口 理孝 (2021) 「接木の成立メカニズムの解明と異科接木の農業利用」 バイオサイエンスとインダストリー VOL.79 NO.1
特許/Patents
- 特許 "接木改善剤" 特開2020-150856 野田口理孝、白武勝裕、黒谷賢一、田畑亮、川勝弥一、河口航平、深尾陽一郎、中林亮、花田耕介
- 特許 Gene to provide environmental stress tolerance and the use thereof. , Takeda, S., Hattori, T., Kurotani, K. and Ichikawa, H. , 出願番号( 15/399,214 , 2017年01月) , アメリカ合衆国
- 特許 ”環境ストレス耐性を付与する遺伝子及びその利用” 特開2016-103994 武田真、服部束穂、黒谷賢一、市川裕章
- 特許 “植物の開花を遅延させるDNA発現カセット” 特開2008-54512 島本功、黒谷賢一
- 特許 “フラジェリンタンパク質による病害抵抗性植物を作出する方法” 特開2004-24160高倉由光、堤史樹、黒谷賢一、石田祐二、蔡晃植
学会・シンポジウム発表等/Presentations
- 黒谷賢一,田畑亮,川勝弥一,杉田亮平,岡安浩次,田野井慶太郎,野田口理孝 (2022) "接木後の組織修復におけるオートファジー誘導の発見" 第63回日本植物生理学会年会
- 黒谷賢一 野田口 理孝(2021)"植物体内を長距離移動するmRNAの研究" 第44回 日本分子生物学会年会 ワークショップ「不均一環境変動に対する植物の情報統御機構」
- 黒谷賢一 Chaokun Huang 岡安浩二 鈴木孝征 野田口 理孝 (2021) "ナス目植物のトランスクリプトーム比較から見えてきた植物の接木の科学" 植物バイオインフォマティクス研究会
- 黒谷賢一 Chaokun Huang 岡安浩二 鈴木孝征 野田口 理孝 (2021) "ペチュニアにおける異科接木に関する研究" 日本植物学会第85回大会
- 黒谷賢一 田畑 亮 川勝弥一 若竹崇雅 白須賢 野田口理孝 (2021) ““接ぎ木”と“寄生”の接着におけるβ-1,4-グルカナーゼ遺伝子についての研究” 第62回植物生理学会年会
- 黒谷賢一 若竹崇雅 市橋泰範 岡安浩二 澤井優 小川哲史 Cui Songkui 鈴木孝征 白須賢 野田口理孝 (2020) “寄生植物Phtheirospermum japonicumと宿主植物の組織癒合における分泌型β-1,4-グルカナーゼの機能解析” 日本植物学会第84回大会
- 黒谷賢一 筒井大貴 澤井優 鈴木孝征 野田口理孝 (2020) “植物におけるmRNAの移動性モチーフの同定” 第61回植物生理学会年会
- 黒谷賢一 筒井大貴 澤井優 鈴木孝征 野田口理孝 (2019) “植物mRNAの移動性モチーフの発見” 植物RNA研究ネットワークシンポジウム
- Ken-ichi Kurotani Hiroki Tsutsui Yu Sawai Takamasa Suzuki Michitaka Notaguchi (2019) “Identification of long-distance mobile mRNA and discovery of consensus sequence for RNA mobility in Plants” Cold Spring Harbor Asia Conference PLANT CELL & DEVELOPMENTAL
BIOLOGY
- 黒谷賢一 筒井大貴 澤井優 鈴木孝征 野田口理孝 (2019) “植物における長距離移動性mRNAの接木を利用した同定” 植物フロンティア研究会
- 黒谷賢一 筒井大貴 澤井優 鈴木孝征 野田口理孝 (2019) “植物における長距離移動性mRNAの接木を利用した同定” 日本植物学会第83回大会
- 黒谷賢一 筒井大貴 澤井優 鈴木孝征 野田口理孝 (2019) “植物における長距離移動性mRNAの同定” 第60回植物生理学会年会
- 黒谷賢一、加藤大和、高藤良典、小林裕子、小林一成、佐藤豊、桧原健一郎、長戸康郎、北野英己、In-Sun Yoon、武田真、服部束穂 (2015) "イネ胚乳発生異常変異体endosperm defective 1 (end1)の原因遺伝子はシキミ酸経路初発酵素をコードする" 第128回講演会(平成27年度秋季大会)
- 黒谷賢一、林憲志、畑中彩希、戸田陽介、小川大輔、市川裕章、石丸泰寛、田下諒、鈴木健史、上田実、服部束穂、武田真 (2015) "CYP94ファミリー遺伝子の発現上昇はイネの塩処理条件下での生存能を高める" 第56回植物生理学会年会 要旨集pp354
- Ken-ichi Kurotani, Hirokazu Katoh, Takamasa Suzuki, Yuhko Kobayashi, Issei Kobayashi, Yutaka Sato, Yasuo Nagato, Hidemi Kitano, In-Sun Yoon, Shin Takeda and Tsukaho Hattori (2014) "Characterization of Rice Seed Mutants
--- Toward Identification of Mutated Loci Using NGS. 第12回日仏植物科学ワークショップ「植物の環境応答」
- Ken-ichi Kurotani, Kazumasa Yamanaka, Daisuke Ogawa, Yosuke Toda, Maiko Tanaka, Akiko Yamamoto, Hirokazu Kato,Hiroaki Ichikawa, Tsukaho Hattori, Shin Takeda (2011) “Evaluation of rice genes by comparative analysis of environmental stress tolerance profile using rice FOX lines.” International Symposium"Strategies of Plants against Global Environmental Change"
- 黒谷賢一、山中一将、小川大輔、水谷恵、戸田陽介、田中舞子、山本章子、加藤大和、市川裕章、服部束穂、武田真 (2010) “イネFOX系統を利用した環境ストレス耐性遺伝子の同定と解析” 第33回日本分子生物学会年会
- 黒谷賢一、山中一将、小川大輔、水谷恵、戸田陽介、田中舞子、山本章子、加藤大和、市川裕章、服部束穂、武田真 (2010) “FOXハンティングシステムを利用したイネの環境ストレス耐性関連遺伝子のスクリーニング” 第51回日本植物生理学会年会 要旨集pp334
- 黒谷賢一、山中一将、小川大輔、水谷恵、戸田陽介、田中舞子、山本章子、加藤大和、市川裕章、服部束穂、武田真 (2009) “FOX hunting systemを利用したイネの環境ストレス耐性関連遺伝子の探索” 第32回日本分子生物学会年会
- 黒谷賢一、山中一将、小川大輔、水谷恵、戸田陽介、田中舞子、山本章子、加藤大和、市川裕章、服部束穂、武田真 (2009) “FOXハンティング法を利用したイネの環境ストレス耐性遺伝子の探索” 第50回日本植物生理学会年会 要旨集 pp345
- 黒谷賢一、賀屋秀隆、柴原慶一、田畑哲之、篠崎一雄、荒木崇 (2007) “シロイヌナズナにおけるクロマチン構築因子群ASF1およびFASの機能” 第48回日本植物生理学会年会、S51
- 黒谷賢一、賀屋秀隆、柴原慶一、荒木崇 (2006) “シロイヌナズナにおけるクロマチン構築因子群ASF1およびFASの機能” 第47回日本植物生理学会年会、S141
- 黒谷 賢一、賀屋 秀隆、柴原 慶一、田畑 哲之、篠崎 一雄、荒木 崇 (2005) “シロイヌナズナにおけるクロマチン構築因子群ASF1およびFASの解析” 第28回日本分子生物学会年会
- 池田美香、黒谷賢一、横井修司、島本功 (2004) “Tandem Affinity purification (TAP)を利用したイネ花成因子Hd3aタンパク質の機能解析” 第27回日本分子生物学会年会
- Makoto Abe, Ken-ichi Kurotani, Mika Ikeda, Shuji Yokoi, and Ko Shimamoto (2004) “Search for OsGI (a rice orthologue of the Arabidopsis GI) interacting proteins by tandem affinity purification (TAP) system” 2nd International Symposium on Rice Functional Genomics.
- 黒谷賢一、泉井桂 (2001) “トウモロコシにおける光制御性リボヌクレアーゼ(RNase)の同定”第42回日本植物生理学会年会 s138
- Ken-ichi Kurotani, Shingo Hata, and Katsura Izui (1997) "Analyses of light-induced expression of the gene for phosphoenolpyruvate carboxylase in maize." PLANT PHYSIOLOGY 114, 3, 1303
- 黒谷賢一、畑信吾、泉井桂 (1996) “トウモロコシのホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ遺伝子の光による発現応答の解析”第37回日本植物生理学会年会 s63
科学研究費補助金/Funding
- ベンサミアナタバコのゲノム解析に基づく植物の接木分子基盤解明 2022年度 基盤研究(C) 代表者
- 植物の移行性mRNAの輸送機構および機能に関する研究 2020年度 基盤研究(B) 分担者
- DNA損傷応答蛋白質の網羅的インタラクトーム解析 2018年度 基盤研究(C) 代表者